Sitede Ara
Kanser Genetiği

ONCOSEQ PLUS TÜMÖR MUTASYON YÜKÜ PANELİ (TMB+)

ONCOSEQ PLUS TÜMÖR MUTASYON YÜKÜ PANELİ (TMB+)

(486 DNA GENİ + MSI + 26 RNA GENİ+ PD-L1(IHC))

Kanser tedavisinde daha etkili ve net sonuçlar alabilmek için biyobelirteç (biyomarker) keşfi üzerindeki araştırmalar hızla devam etmektedir. Kanserde en sık uygulanan ve şimdiye kadar etkinliğinin en yüksek olduğu bilinen tedavi yöntemi kemoterapi idi. Kemoterapötikler hücre ölümüne neden olan güçlü ilaçlardır.
Ancak, sadece kanser hücrelerinin ölümü üzerinde değil, vücuttaki tüm hücreler üzerinde etkilidirler. En çok etki gösterdiği hücre grubu hızlı bölünen hücreler olduğu için, kanser hücrelerinde ve vücuttaki diğer hızlı bölünen hücrelerde belirgin etkinlik gösterirler.

  • Test:
    Tümör Mutasyon Yükü Testi
  • Yöntem:
    Yeni Nesil Dizileme
  • Analiz Süresi:
    14-21 Gün
  • Örnek Türü:
    FFPE(DOKU), Kan (EDTA’lı) ve cfDNA
  • Saklama Koşulları:
    +4 C’de 1 hafta
  • Taşıma Koşulları:
    Aynı gün; oda sıcaklığında
  • Red Kriterleri:
    Hemolizli, Lipemik, İkterik örnek kabul edilmez

Kemoterapi yan etkileri de vücuttaki hızlı bölünen normal fizyolojideki hücrelerin etkilenmesi sonucu oluşur ve kişinin yaşamını tehdit edecek boyutlara ulaşabilir.

Kanseri hedef alacak olan tedavi yöntemleri ile yan etkilerin yarattığı sorunlardan kurtulunmuş olunacağı gibi kansere spesifik tedavi imkânı da sağlanmış olacağı için bu yöndeki son yıllarda yapılan kapsamlı araştırmaların neticesinde “akıllı ilaç tedavileri” ve “immunoterapi” gibi daha etkili ve kansere özgü tedavi yöntemleri geliştirilmeye başlanmıştır. Kansere özgü biyobelirteç keşifleri sayesinde hastalığın neden oluştuğunun ayrıntıları, hastalığın izleminde nelerle karşılaşılacağı (prognoz) ve tedavi yanıtının neye göre nasıl olacağı soruları yanıtlanmaya başlanmıştır.

Yapılan biyobelirteç ve kanser ilişkisi araştırmalarının sonuçlarında fark edilen yeni bir kavram olan “tümör mutasyon yükü (TMB), bir tümördeki toplam mutasyon sayısını ifade eder. Genomumuzda doğuştan beri var olmayıp, sadece tümör hücrelerinde oluşan mutasyonlar olan “somatik mutasyonlar”, pek çok genomik veri ve algoritma birlikte kullanılarak yeni nesil yöntemlerle analiz edilip hesaplanabilir.

Tümör mutasyon yükü belli bir düzeyin üstünde olan tümörlerde, immunoterapi yanıtının daha iyi olduğu bulunmuştur. Kanser hücrelerinin gelişim ve yayılma basamaklarında immun sistem (bağışıklık sistemi) hücrelerimiz kanserle savaşta iyi amaçlı hareket etseler de immun hücrelerin ürettiği moleküllere bağlı olarak olumsuz yöne de etki edebilir. Somatik mutasyonların miktarı neoantijenlerin yükünü yansıtır, yani TMB’nin yüksek olduğu durumlarda neoantijenlerin ekspresyonu da yüksektir.

Uluslararası bir organizasyon olan “Foundation Medicine”, şimdiye kadar 21 kanser türü için 1300’den fazla hastada araştırma gerçekleştirmiştir. İlk olarak küçük hücreli dışı akciğer kanserinde (NSCCA), artmış tümör yükü olan hastalarda kombine immunoterapinin progresyonsuz sağkalımda artışa neden olduğu gözlenmiştir.

PD-L1 (programlanmış hücre ölüm ligandı): İmmun sistemden sağlıklı hücrelerin kaçışına izin veren bir moleküldür. İmmun sistemin fazla reaksiyon vermesini baskılar. Tümör hücrelerinin bu kontrol noktasını bloke edip bağışıklık hücrelerinden (T hücreler) kaçabilme özelliği vardır. İmmunoterapi ile kontrol noktası inhibitörleri görev alır, PD-L1 aktivitesini azaltır, T hücreleri tekrar aktifleşir ve kanser hücrelerine yönelir. PD-L1 ekspresyonuna immunohistokimya analizleri ile bakılabilir. Bulunan skor yüksek ise immunoterapiden faydalanım olabileceği anlamına gelir. İmmunohistokimya ile yapılan bu analizin dezavantajı, hazırlanmasının zor ve sonuç yorumlarının öznel olmasıdır.

ONCOSEQ PLUS TÜMÖR MUTASYON YÜKÜ PANELİ (TMB+)

486 DNA GENİ + MSI + 26 RNA GENİ+ PD-L1 (IHC)
+

ABCB9v BARD1 CD70 CTNNB1 ERCC1 FH HLA-C KAT6A MCM6 MYOCD PDK1 PSMA5 PSMD5 RB1 SMAD2 TCP11L2
ABL1 BCL2 CD79A CTSB ERCC2 FKBP9 HLA-E KDM5A MCM7 NBN PHF6 PSMA6 PSMD6 RBM10 SMAD3 TDG
ABL2 BCL2L1 CD79B CTSL ERCC3 FLCN HLA-F KDM5C MDM2 NCOR1 PIK3C2B PSMA7 PSMD7 REL SMAD4 TERC
ACE2 BCL6 CD80 CTSS ERCC4 FLT1 HLA-G KDM6A MDM4 NF1 PIK3CA PSMA8 PSMD8 RET SMARCA4 TERT
ACVR1B BCOR CD86 CUL3 ERCC5 FLT3 HMGB1 KDR MED12 NF2 PIK3CB PSMB1 PSMD9 RFC1 SMARCB1 TET2
AKT1 BCORL1 CDC27 CUL4B ERG FLT4 HMGN1 KEAP1 MEF2B NFE2L2 PIK3CG PSMB10 PSME1 RFC2 SMC1A TGFBR2
AKT2 BLM CDC73 CUX1 ERRFI1 FOXA1 HNF1A KEL MEN1 NFKBIA PIK3R1 PSMB11 PSME2 RFC3 SMC3 TNF
AKT3 BRAF CDH1 CYLD ESR1 FOXL2 HRAS KIT MET NKX2-1 PIK3R2 PSMB2 PSME3 RFC4 SMO TNFAIP3
ALK BRCA1 CDK12 DAXX ETV6 FOXP1 HSP90AA1 KMT2A MICA NOTCH1 PIM1 PSMB3 PSME4 RFC5 SOCS1 TNFRSF14
ALPK2 BRCA2 CDK4 DDR2 EWSR1 FUBP1 ICOSLG KMT2C MICB NOTCH2 PLCG2 PSMB4 PSMF1 RHEB SOS1 TNFRSF9
AMER1 BRD4 CDK6 DDX3X EXO1 GABRA6 IDE KMT2D MITF NOTCH3 PMS1 PSMB5 PSMG1 RHOA SOX10 TNFSF14
APC BRIP1 CDK8 DICER1 EZH2 GADD45A IDH1 KRAS MLH1 NOTCH4 PMS2 PSMB6 PSMG2 RICTOR SOX17 TNFSF18
AR BTK CDKN1A DIS3 FAM46C GATA1 IDH2 LGALS9 MLH3 NPEPPS POLB PSMB7 PSMG3 RIT1 SOX2 TNFSF4
ARAF C10orf54 CDKN1B DMD FANCA GATA2 IFI30 LGMN MORC4 NPM1 POLD1 PSMB8 PSMG4 RNASEH2A SOX9 TNFSF9
ARID1A CALR CDKN2A DNER FANCC GATA3 IGF1R LIG1 MPL NRAS POLD2 PSMB9 PTCH1 RNF43 SPEN TNKS
ARID1B CANX CDKN2B DNMT3A FANCD2 GATA4 IGF2 LIG3 MR1 NRDC POLD3 PSMC1 PTEN ROS1 SPOP TOP1
ARID2 CARD11 CDKN2C DOT1L FANCE GATA6 IGF2R LMO1 MRE11A NSD1 POLD4 PSMC2 PTGS2 RPA1 SRC TP53
ARID5B CASP8 CEBPA EED FANCF GLi1 IKBKE LNPEP MSH2 NTRK1 POLE PSMC3 PTPN11 RPA2 SSBP1 TP53BP1
ASXL1 CBFB CHD4 EGFR FANCG GNA11 IKZF1 LPAR2 MSH3 NTRK2 POLE4 PSMC4 PTPRD RPA3 STAG2 TPP2
ASXL2 CBL CHEK1 EP300 FAS GNA13 IL7R LRP1B MSH4 NTRK3 PPP2R1A PSMC5 QKI RPA4 STAT3 TPP2
ATM CCND1 CHEK2 EPCAM FAT1 GNAQ INPP4B LZTR1 MSH5 PALB2 PRDM1 PSMC6 RAC1 RPTOR STK11 TREX1
ATR CCND2 CIC EPHA3 FBXW7 GNAS IRF4 MAP2K1 MSH6 PARK2 PRKAR1A PSMD1 RAD17 RUNX1 SUFU TRRAP
ATRX CCND3 CNKSR1 EPHA5 FGF19 GRIN2A IRF6 MAP2K2 MTOR PARP1 PRKCG PSMD10 RAD18 RUNX1T1 SUZ12 TSC1
AURKA CCNE1 COL5A1 EPHA7 FGF3 GSK3B IRS2 MAP2K4 MUC17 PAX5 PRKCI PSMD11 RAD21 SDHA SYK TSC2
AURKB CD200 CREBBP EPHB1 FGF4 H3F3A ITGAV MAP3K1 MUTYH PBRM1 PRKCZ PSMD12 RAD50 SDHB TAP1 TSHR
AXIN1 CD274 CRKL ERAP1 FGFBP1 HERC1 ITGB3 MCL1 MYB PCNA PRKDC PSMD13 RAD51 SDHC TAP2 U2AF1
AXIN2 CD276 CRLF2 ERAP2 FGFR1 HGF JAK1 MCM2 MYC PDCD1LG2 PSMA1 PSMD14 RAD51C SDHD TAPBP VEGFA
AXL CD40 CSF1R ERBB2 FGFR2 HIST1H3B JAK2 MCM3 MYCL PDGFRA PSMA2 PSMD2 RAF1 SETD2 TAPBPL VEGFD
B2M CD40LG CTCF ERBB3 FGFR3 HLA-A JAK3 MCM4 MYCN PDGFRB PSMA3 PSMD3 RARA SF3B1 TBX3 VHL
BAP1 CD48 CTNNA1 ERBB4 FGFR4 HLA-B JUN MCM5 MYD88 PDIA3 PSMA4 PSMD4 RASA1 SIRT1 TCF7L2 VTCN1
WEE1 WT1 XPO1 XRCC5 ZFHX3 ZNF217

ALK BRAF BRD4 EGFR ERG ETVl ETV4 ETV6 EWSRl FGFRl FGFR2 FGFR3 MET
MYB NOTCH2 NRGl NTRKl NTRK2 NTRK3 NlJTMl PDGFRA PDGFRB RET ROS1 TERT TFE

ONCOSEQ TÜMÖR MUTASYON YÜKÜ PANELİ (TMB)

486 DNA GENİ +MSI+ PD-L1 (IHC)
+

ABCB9v BARD1 CD70 CTNNB1 ERCC1 FH HLA-C KAT6A MCM6 MYOCD PDK1 PSMA5 PSMD5 RB1 SMAD2 TCP11L2
ABL1 BCL2 CD79A CTSB ERCC2 FKBP9 HLA-E KDM5A MCM7 NBN PHF6 PSMA6 PSMD6 RBM10 SMAD3 TDG
ABL2 BCL2L1 CD79B CTSL ERCC3 FLCN HLA-F KDM5C MDM2 NCOR1 PIK3C2B PSMA7 PSMD7 REL SMAD4 TERC
ACE2 BCL6 CD80 CTSS ERCC4 FLT1 HLA-G KDM6A MDM4 NF1 PIK3CA PSMA8 PSMD8 RET SMARCA4 TERT
ACVR1B BCOR CD86 CUL3 ERCC5 FLT3 HMGB1 KDR MED12 NF2 PIK3CB PSMB1 PSMD9 RFC1 SMARCB1 TET2
AKT1 BCORL1 CDC27 CUL4B ERG FLT4 HMGN1 KEAP1 MEF2B NFE2L2 PIK3CG PSMB10 PSME1 RFC2 SMC1A TGFBR2
AKT2 BLM CDC73 CUX1 ERRFI1 FOXA1 HNF1A KEL MEN1 NFKBIA PIK3R1 PSMB11 PSME2 RFC3 SMC3 TNF
AKT3 BRAF CDH1 CYLD ESR1 FOXL2 HRAS KIT MET NKX2-1 PIK3R2 PSMB2 PSME3 RFC4 SMO TNFAIP3
ALK BRCA1 CDK12 DAXX ETV6 FOXP1 HSP90AA1 KMT2A MICA NOTCH1 PIM1 PSMB3 PSME4 RFC5 SOCS1 TNFRSF14
ALPK2 BRCA2 CDK4 DDR2 EWSR1 FUBP1 ICOSLG KMT2C MICB NOTCH2 PLCG2 PSMB4 PSMF1 RHEB SOS1 TNFRSF9
AMER1 BRD4 CDK6 DDX3X EXO1 GABRA6 IDE KMT2D MITF NOTCH3 PMS1 PSMB5 PSMG1 RHOA SOX10 TNFSF14
APC BRIP1 CDK8 DICER1 EZH2 GADD45A IDH1 KRAS MLH1 NOTCH4 PMS2 PSMB6 PSMG2 RICTOR SOX17 TNFSF18
AR BTK CDKN1A DIS3 FAM46C GATA1 IDH2 LGALS9 MLH3 NPEPPS POLB PSMB7 PSMG3 RIT1 SOX2 TNFSF4
ARAF C10orf54 CDKN1B DMD FANCA GATA2 IFI30 LGMN MORC4 NPM1 POLD1 PSMB8 PSMG4 RNASEH2A SOX9 TNFSF9
ARID1A CALR CDKN2A DNER FANCC GATA3 IGF1R LIG1 MPL NRAS POLD2 PSMB9 PTCH1 RNF43 SPEN TNKS
ARID1B CANX CDKN2B DNMT3A FANCD2 GATA4 IGF2 LIG3 MR1 NRDC POLD3 PSMC1 PTEN ROS1 SPOP TOP1
ARID2 CARD11 CDKN2C DOT1L FANCE GATA6 IGF2R LMO1 MRE11A NSD1 POLD4 PSMC2 PTGS2 RPA1 SRC TP53
ARID5B CASP8 CEBPA EED FANCF GLi1 IKBKE LNPEP MSH2 NTRK1 POLE PSMC3 PTPN11 RPA2 SSBP1 TP53BP1
ASXL1 CBFB CHD4 EGFR FANCG GNA11 IKZF1 LPAR2 MSH3 NTRK2 POLE4 PSMC4 PTPRD RPA3 STAG2 TPP2
ASXL2 CBL CHEK1 EP300 FAS GNA13 IL7R LRP1B MSH4 NTRK3 PPP2R1A PSMC5 QKI RPA4 STAT3 TPP2
ATM CCND1 CHEK2 EPCAM FAT1 GNAQ INPP4B LZTR1 MSH5 PALB2 PRDM1 PSMC6 RAC1 RPTOR STK11 TREX1
ATR CCND2 CIC EPHA3 FBXW7 GNAS IRF4 MAP2K1 MSH6 PARK2 PRKAR1A PSMD1 RAD17 RUNX1 SUFU TRRAP
ATRX CCND3 CNKSR1 EPHA5 FGF19 GRIN2A IRF6 MAP2K2 MTOR PARP1 PRKCG PSMD10 RAD18 RUNX1T1 SUZ12 TSC1
AURKA CCNE1 COL5A1 EPHA7 FGF3 GSK3B IRS2 MAP2K4 MUC17 PAX5 PRKCI PSMD11 RAD21 SDHA SYK TSC2
AURKB CD200 CREBBP EPHB1 FGF4 H3F3A ITGAV MAP3K1 MUTYH PBRM1 PRKCZ PSMD12 RAD50 SDHB TAP1 TSHR
AXIN1 CD274 CRKL ERAP1 FGFBP1 HERC1 ITGB3 MCL1 MYB PCNA PRKDC PSMD13 RAD51 SDHC TAP2 U2AF1
AXIN2 CD276 CRLF2 ERAP2 FGFR1 HGF JAK1 MCM2 MYC PDCD1LG2 PSMA1 PSMD14 RAD51C SDHD TAPBP VEGFA
AXL CD40 CSF1R ERBB2 FGFR2 HIST1H3B JAK2 MCM3 MYCL PDGFRA PSMA2 PSMD2 RAF1 SETD2 TAPBPL VEGFD
B2M CD40LG CTCF ERBB3 FGFR3 HLA-A JAK3 MCM4 MYCN PDGFRB PSMA3 PSMD3 RARA SF3B1 TBX3 VHL
BAP1 CD48 CTNNA1 ERBB4 FGFR4 HLA-B JUN MCM5 MYD88 PDIA3 PSMA4 PSMD4 RASA1 SIRT1 TCF7L2 VTCN1
WEE1 WT1 XPO1 XRCC5 ZFHX3 ZNF217

Genetik Mirasınızı Keşfedin

Genetik testlerimiz, danışmanlık hizmetlerimiz ve daha fazlası hakkında bilgi almak için bizimle iletişime geçebilirsiniz.

Bize Ulaşın

ONCOSEQ DNALAB (Kanser Genetiği)

PRİMİS Non-İnvaziv Prenatal Test

Preimplantasyon Genetik Tanı (PGT)

Tüm Ekzom Dizileme

Klinik Ekzom Dizileme

Nadir Hastalıklar

Taşıyıcılık Panelleri- SMARİS